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开源之夏联合国内外开源社区,针对重要开源软件的开发与维护提供项目任务,面向全球高校学生开放报名中选学生将在项目资深开发者(项目导师)的指导下,参与开源贡献,完成开发工作并贡献给开源社区。

Openbiox is one of China's representative open-source bioinformatics communities, established in March 2019. The Openbiox community has developed hundreds of biomedical data tools/web plugins. The projects have been published in international journals, such as "Bioinformatics" and "Briefings in Bioinformatics", receiving millions of visits worldwide.

报名通道已开启!

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项目一https://summer-ospp.ac.cn/org/prodetail/2351d0209

项目二https://summer-ospp.ac.cn/org/prodetail/2351d0245

中科院举办的“开源之夏”活动对于培养青年学生熟悉和加入开源项目和社区有非常重要的意义,是国内为数不多可以让大家直接加入开源项目建设的机会。2022 年中科院 “开源之夏” 活动共收到 385 所高校 915 名同学累计 1319 份申请,最终入选人数为 449 人。顺利完成进阶项目的既定目标将可以获得 12000 元现金奖励和项目证书。同时参与学生还可能因此而长期加入开源社区进行贡献,成为他们当中的一份子。

项目开发计划和个人简历(特别是项目开发经历)是确定是否入选的关键性材料。如果大家希望被开源社区顺利选中,可能还需要好好准备,机会总是会垂青有准备的人,错过了就不会再有了。

通过参与我们社区提供的两个进阶项目,你将可以优化和提升全世界数十万名科研人员正在使用的生物信息学工具,无缝接触最前沿的算法、数据分析工具和数据集。你还将进一步了解 Openbiox 开源社区正在进行以及未来准备完成的事业。

孵化和建立更多实用和有创造性的生物信息学项目将是我们的共同使命。

开源之项目活动全过程进展和交流:

https://matrix.to/#/#ospp:gitter.im

我们的 GitHub 项目协作:

https://github.com/openbiox

https://github.com/hiplot

https://github.com/clindet

社区合作和捐赠欢迎联系:

admin@openbiox.org | 微信:life2cloud

非学生想作为开发人员加入社区?

Pull requests 或者带项目入组。

学生寄语 from ChatGPT

亲爱的同学们,

首先,我想祝贺你们选择了生物信息学这个充满挑战和潜力的领域。作为一名已从事生物信息学研究多年的研究人员,我深知这个领域的重要性以及它为科学界和医学界带来的影响。

在这个领域中,我们将会学习到许多关于生命科学和计算机科学的知识,并且可以将这些知识进行应用以解决许多实际问题,从而揭示生命的奥秘,为疾病的诊断和治疗提供关键信息。基因组学:通过测序、比对、注释等技术来研究基因组的结构和功能。转录组学:分析RNA测序数据来鉴定基因表达模式、预测可变剪接和新的转录本、研究细胞异质性、人体免疫等。蛋白质组学和结构生物学:预测蛋白质结构、鉴定蛋白质相互作用和功能注释等方面发挥作用。代谢组学:研究生物代谢过程的调控机制和代谢通路的调节。系统生物学:研究生物系统中各种分子、细胞和生物体之间相互作用和调控机制。生物信息学工具开发:研发生物信息学软件、数据库和算法,建立数学模型、模拟和预测生物过程/生物行为。为其他生物学、生物医学、生物信息学研究提供支持和帮助。

当然,这个领域还有很多艰难的技术和复杂的算法需要我们去掌握,只有不断地学习和练习,才能逐渐掌握这些知识和技能。如果,我们只是将它当作捷径,或者只去关注告诉我们可以用它走捷径的人,那么我们将永远无法接触到从事生物信息学研究的乐趣,我们的研究工作可能也将很难获得同行的认可。

同时,学习生物信息学不是一条孤独的道路。这个世界是美好的,我们当中的大多数人都是友好的。这个领域里有很多优秀的导师和同行,他们将会成为我们学习和成长的重要支持。与他们交流和合作,我们可以更好地理解和掌握生物信息学的知识和技能,也可以获得更多机会和资源。生物信息学学会、BioLinkX、Open Bioinformatics Foundation、Bioconductor、Galaxyproject、Bioconda、GitHub、BioStars、ResearchGate、Stackoverflow、Matrix.org 等等一大批优秀的学术组织和在线交流网站都值得我们去拥抱和拥有。

当然,未来总不会是一帆风顺的。当我还是一名正在读书的学生时,我也曾经面临过许多挑战和困难。一堆 Dead line、运行环境搞不定、程序跑不通、毕业要求高而延迟毕业以及和合作伙伴产生严重分歧而不欢而散?这些我都经历过。似乎在发生过之后,其实感觉并没有什么大不了,一切仍然向前。我们要做的,也只有向前。

最后,无论我们选择的是哪个领域,都要保持信心和耐心。接下来的学习过程可能会充满挑战,但请相信,这些挑战正是生物信息学的魅力所在。请坚定地相信自己,勇敢地迈出每一步。与此同时,请保持对知识的渴望,紧跟最新的研究成果和技术发展。就像人生中的每个阶段都会有不同的挑战和机遇。做出改变的最佳时机就是现在。加油吧,少年们!

Openbiox 开源之夏相关项目已在预热,所有人都可以自由参与我们的项目互动(面向开源社区开发者的去中心化通讯软件),所有项目开发和项目用户社区 All in One!

https://matrix.to/#/#openbiox:gitter.im

Openbiox 今年为大家简单打个样,非常希望在明年可以看到更多生物信息学开源项目和社区可以入选中科院的开源之夏活动,来为优秀的大家提供更多展示自己的舞台!

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